الهدف من علاج جذور الأسنان، هو علاج العدوى الناتجة عن التسوس والمنتقلة ضمن طبقات السن كافة، وصولاً إلى عصب السن، بحيث يمكننا الحفاظ على بنية الجذر بشكلها السليم، من خلال إزالة الأنسجة المصابة، حيث يتم تنظيف جذور الأسنان بأكملها.
وبعد التأكد من القضاء على البكتيريا والإنتان، يتم ملء أقنية السن والتي هي ضمن الجذور، بمركب أسنان يشبه المطاط بما يسمى حشو أقنية الأسنان، وكإجراء احترازي نهائي، نوصي بوضع تاج الأسنان، الذي سيوفر طبقة إضافية من الحماية. وهنا للمريض أن يسأل هل ستضعف هذه العملية قوة السن؟ والجواب يكون بنعم، ولكن بنسبة أقل، والتي يمكن تعويضها عن طريق تركيب تاج معزز للسن كما ذكرنا سابقاً، بشرط أن تكون عمليه علاج الجذور دقيقة ومثالية. من جهة أخرى نقول إن لعملية علاج الجذور العديد من الفوائد، أبرزها الحفاظ على الأسنان الطبيعية والراحة من الألم.